公募研究の目的は、「イスラーム地域研究」の諸分野の共同研究の拠点を整備・強化することの一環として、研究をさらに発展させるために、国公私立大学等に所属する研究者たちに広く呼びかけ、共同研究の質的向上と研究参加者の拡大を図るとともに、広い分野からの参加による研究の向上・発展を目指すことです。
2008年7～9月にかけて公募をおこない、計21件の応募があり、採択研究課題一覧にある5件の共同研究課題が採択されました。

2010年には、早稲田大学拠点と東京大学拠点において、新たに共同研究課題の公募を実施し、2件の共同研究課題が採択されました。